고처리량 DNA 시퀀싱의 깊이는 왜고, RNA 시퀀싱은 몇 미터인가요?

RNA 발현의 시공간적, 시간적 특이성으로 인해 서로 다른 조직에서 서로 다른 시간 또는 동시에 발현되는 RNA 발현 수는 크게 다르기 때문에 RNA 시퀀싱의 양을 논할 수는 없습니다. 데이터를 시퀀싱 깊이로 표현하면 충분합니다. 일반적으로 RNA 시퀀싱에 대해 이야기할 때 우리는 측정한 클러스터, 즉 중단된 RNA 분자 수에 대해 이야기합니다. 예를 들어 특정 RNA 샘플은 더블 엔드 시퀀싱 기술을 사용하여 시퀀싱을 위해 3천만(3천만)개의 클러스터를 사용합니다. 즉, 각 클러스터를 양쪽 끝에서 테스트하고 각 테스트는 150bp이므로 읽기 횟수는 30M*이 됩니다. 2=60M이면 읽기 횟수에 각 읽기 길이를 곱한 값이 최종 시퀀싱 데이터 볼륨(염기 수)이며, 이는 60M*150=9G 염기입니다.